Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD06

Rarres2, Retinoic acid receptor responder protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres2Q9DD06 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rarres2Q9DD06 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms