Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnft1Q9DCN7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.3 ms