Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a2Q9D8F3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms