Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn22Q9D7U6 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms