Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MsraQ9D6Y7 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms