Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PudpQ9D5U5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms