Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TpbpbQ9CQC0 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TpbpbQ9CQC0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TpbpbQ9CQC0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TpbpbQ9CQC0 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TpbpbQ9CQC0 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TpbpbQ9CQC0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TpbpbQ9CQC0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TpbpbQ9CQC0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TpbpbQ9CQC0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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TpbpbQ9CQC0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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TpbpbQ9CQC0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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TpbpbQ9CQC0 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TpbpbQ9CQC0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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TpbpbQ9CQC0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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