Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm44187-201ENSMUST00000204735 1929 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Cxcl2-201ENSMUST00000075433 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn4Q99P72 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms