Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln4Q99NB8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ubqln4Q99NB8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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