Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrrtQ99MR6 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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