Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gdpd3Q99LY2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms