Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Smim11aQ99J19 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Smim11aQ99J19 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Smim11aQ99J19 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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