Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Rnf144aQ925F3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rnf144aQ925F3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rnf144aQ925F3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rnf144aQ925F3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rnf144aQ925F3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rnf144aQ925F3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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