Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 Dpp4-201ENSMUST00000047812 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SptssbQ925E8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Myo6-212ENSMUST00000184480 4139 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Ldlr-202ENSMUST00000213114 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Gm20682-201ENSMUST00000176552 3517 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SptssbQ925E8 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms