Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Csmd1Q923L3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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