Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Med28Q920D3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms