Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf4Q8VE97 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms