Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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