Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms