Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Pramef8Q8CE24 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Pramef8Q8CE24 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Pramef8Q8CE24 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Pramef8Q8CE24 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms