Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Olfr621-ps1-201ENSMUST00000119741 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Trp63-206ENSMUST00000115307 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Tnfaip8-213ENSMUST00000180305 369 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trim35Q8C006 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Pudp-201ENSMUST00000056460 1044 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trim35Q8C006 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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