Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Tnfsfm13Q8BXS2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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