Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms