Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Amigo1Q80ZD8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms