Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Atg2bQ80XK6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg2bQ80XK6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms