Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms