Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ssx9Q6XAS3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ssx9Q6XAS3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ssx9Q6XAS3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssx9Q6XAS3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssx9Q6XAS3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssx9Q6XAS3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssx9Q6XAS3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssx9Q6XAS3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssx9Q6XAS3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssx9Q6XAS3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssx9Q6XAS3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssx9Q6XAS3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssx9Q6XAS3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssx9Q6XAS3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssx9Q6XAS3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssx9Q6XAS3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssx9Q6XAS3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssx9Q6XAS3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms