Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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