Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atp8b3Q6UQ17 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms