Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms