Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Ccdc18Q640L5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Ccdc18Q640L5 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Ccdc18Q640L5 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Ccdc18Q640L5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Ccdc18Q640L5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Ccdc18Q640L5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Ccdc18Q640L5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Ccdc18Q640L5 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc18Q640L5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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