Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms