Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprnQ60673 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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PtprnQ60673 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprnQ60673 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprnQ60673 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprnQ60673 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprnQ60673 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprnQ60673 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PtprnQ60673 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PtprnQ60673 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PtprnQ60673 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PtprnQ60673 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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PtprnQ60673 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.8 ms