Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccdc185Q3V118 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccdc185Q3V118 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccdc185Q3V118 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccdc185Q3V118 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ccdc185Q3V118 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc185Q3V118 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc185Q3V118 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc185Q3V118 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc185Q3V118 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc185Q3V118 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccdc185Q3V118 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccdc185Q3V118 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccdc185Q3V118 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms