Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp48Q3V0C5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp48Q3V0C5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp48Q3V0C5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp48Q3V0C5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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