Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbm44Q3V089 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms