Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYK3

Tbc1d9, TBC1 domain family member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9Q3UYK3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tbc1d9Q3UYK3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tbc1d9Q3UYK3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tbc1d9Q3UYK3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tbc1d9Q3UYK3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tbc1d9Q3UYK3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tbc1d9Q3UYK3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tbc1d9Q3UYK3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tbc1d9Q3UYK3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tbc1d9Q3UYK3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tbc1d9Q3UYK3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tbc1d9Q3UYK3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tbc1d9Q3UYK3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tbc1d9Q3UYK3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tbc1d9Q3UYK3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tbc1d9Q3UYK3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tbc1d9Q3UYK3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tbc1d9Q3UYK3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tbc1d9Q3UYK3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tbc1d9Q3UYK3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tbc1d9Q3UYK3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms