Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Znf48Q3US17 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Znf48Q3US17 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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