Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec31aQ3UPL0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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