Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Skap2Q3UND0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms