Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U1D9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms