Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms