Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms