Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms