Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
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