Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms