Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms