Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms