Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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