Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms